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磁珠广泛应用于多种分子生物学实验，包括核酸提取与纯化、NGS建库片段筛选、序列特异性捕获；以及多种免疫学实验，如蛋白纯化与免疫（共）沉淀、细胞分离与激活。
免疫试剂的开发建立在抗原和抗体特异相互作用的基础上，其原理是利用高度特异性和灵敏度的抗原抗体反应，检测样本中有无相应的抗体或抗原，在此基础上通常会引入微球或磁珠等载体，以提高试剂的灵敏度等特性，同时也更适用于自动化仪器分析。
多种检测的设备的校准需要用到具有准确粒径和数量浓度的标准微球。除了粒度和计数的校准之外，微球还可用于荧光检测仪器中各荧光通道信号强度以及光路聚焦的校准。
